Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lig3P97386 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms