Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb2P81069 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms