Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms