Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx2P81066 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms