Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptprn2P80560 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms