Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx2P80206 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms