Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CiitaP79621 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CiitaP79621 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms