Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UrodP70697 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UrodP70697 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UrodP70697 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UrodP70697 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UrodP70697 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UrodP70697 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UrodP70697 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UrodP70697 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UrodP70697 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UrodP70697 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms