Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ldb1P70662 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms