Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9xP70398 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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