Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf11P70378 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms