Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms