Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NficP70255 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NficP70255 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NficP70255 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NficP70255 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NficP70255 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NficP70255 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NficP70255 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NficP70255 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NficP70255 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NficP70255 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NficP70255 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NficP70255 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NficP70255 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms