Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb7P70195 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb7P70195 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms