Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf5P70191 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf5P70191 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms