Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms