Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms