Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms