Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3aP63011 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms