Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps3P62908 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps3P62908 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps3P62908 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps3P62908 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms