Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms