Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp46P62069 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms