Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lmo4P61969 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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