Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ufm1P61961 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms