Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms