Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx1bP61264 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms