Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr2fP61219 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr2fP61219 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms