Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2iP60898 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms