Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3eP60229 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms