Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3bP59470 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3bP59470 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms