Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hps5P59438 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms