Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scarf2P59222 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms