Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp3P59055 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp3P59055 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms