Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms