Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mc4rP56450 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc4rP56450 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms