Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cox17P56394 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms