Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh5P55284 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms