Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtskP55097 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtskP55097 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms