Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acod1P54987 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acod1P54987 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acod1P54987 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Acod1P54987 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms