Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms