Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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