Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cux1P53564 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cux1P53564 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cux1P53564 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms