Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhox5P52651 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox5P52651 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms