Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms