Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms