Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SftpbP50405 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SftpbP50405 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SftpbP50405 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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