Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfbP49766 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfbP49766 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms