Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnni3P48787 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms