Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox8bP48772 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox8bP48772 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms