Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd1P48410 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms